Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps41Q5KU39 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps41Q5KU39 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms