Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCBP3Q53F19 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCBP3Q53F19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NCBP3Q53F19 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms