Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm10488Q4KL05 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm10488Q4KL05 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm10488Q4KL05 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms