Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd5Q3V1H9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd5Q3V1H9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms