Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prom2Q3UUY6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prom2Q3UUY6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms