Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam198bQ3UPI1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam198bQ3UPI1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam198bQ3UPI1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms