Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col24a1Q30D77 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col24a1Q30D77 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col24a1Q30D77 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms