Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FXNQ16595 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FXNQ16595 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FXNQ16595 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FXNQ16595 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FXNQ16595 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FXNQ16595 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FXNQ16595 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FXNQ16595 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FXNQ16595 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FXNQ16595 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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