Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC3Q15034 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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