Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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