Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPS1Q13098 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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