Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNIP3Q12983 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP3Q12983 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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