Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 VAM3YOR106W 852 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 KEX1YGL203C 2190 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YJR026WYJR026W 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YJR028WYJR028W 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YAR010CYAR010C 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YML040WYML040W 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YMR051CYMR051C 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 SAT4YCR008W 1812 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 GPI10YGL142C 1851 nt4.35□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YDR444WYDR444W 2064 nt4.34□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 TFA2YKR062W 987 nt4.34□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YNR042WYNR042W 429 nt4.34□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 NAT3YPR131C 588 nt4.34□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 UBS1YBR165W 834 nt4.34□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YPS7YDR349C 1791 nt4.34□□□□□ -1.71
LSP1Q12230 YPR003CYPR003C 2265 nt4.34□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 DAN4YJR151C 3486 nt4.34□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 OCT1YKL134C 2319 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 RIM4YHL024W 2142 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 RGP1YDR137W 1992 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 SLM5YCR024C 1479 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 AHA1YDR214W 1053 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YDR274CYDR274C 372 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 DPH1YIL103W 1278 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 ELF1YKL160W 438 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 IDI1YPL117C 867 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 RPS9BYBR189W 588 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 ALA1YOR335C 2877 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 KIP3YGL216W 2418 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 BUD27YFL023W 2391 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 IKS1YJL057C 2004 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 SIR1YKR101W 1965 nt4.33□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 GGA1YDR358W 1674 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YGL140CYGL140C 3660 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 STB3YDR169C 1542 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 MEF2YJL102W 2460 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 PUS9YDL036C 1389 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YER085CYER085C 522 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YGL188CYGL188C 174 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 SFH5YJL145W 885 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 AUR1YKL004W 1206 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YBL077WYBL077W 432 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 DSC2YOL073C 969 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 MPD1YOR288C 957 nt4.32□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 FAA1YOR317W 2103 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 SSU1YPL092W 1377 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YDR336WYDR336W 945 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YGR015CYGR015C 987 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YIL163CYIL163C 354 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 CDC8YJR057W 651 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 TIS11YLR136C 858 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YLR311CYLR311C 348 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 BAG7YOR134W 1230 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YPL114WYPL114W 420 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YPR059CYPR059C 387 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 RDS1YCR106W 2499 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 TEL1YBL088C 8364 nt4.31□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 GAS4YOL132W 1416 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 TDA6YPR157W 1404 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 RDH54YBR073W 2877 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YFT2YDR319C 825 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 PSY3YLR376C 729 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 SSP2YOR242C 1116 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 KRE5YOR336W 4098 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 ASI1YMR119W 1875 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 UBX5YDR330W 1503 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 CHD1YER164W 4407 nt4.3□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 LAP3YNL239W 1365 nt4.29□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 KTR7YIL085C 1554 nt4.29□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 POP6YGR030C 477 nt4.29□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt4.29□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YRA2YKL214C 612 nt4.29□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 SWC7YLR385C 399 nt4.29□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YMR010WYMR010W 1218 nt4.29□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 MRPS9YBR146W 837 nt4.29□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 CDC45YLR103C 1953 nt4.28□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 PCL2YDL127W 927 nt4.28□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 BUD30YDL151C 582 nt4.28□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 OKP1YGR179C 1221 nt4.28□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt4.28□□□□□ -1.72
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