Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 YJU3YKL094W 942 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 PEX15YOL044W 1152 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ATP19YOL077W-A 207 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 DSS1YMR287C 2910 nt5.34□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 FAR10YLR238W 1437 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 PPH3YDR075W 927 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 BUD25YER014C-A 462 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YGR293CYGR293C 462 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 VMA22YHR060W 546 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YJR141WYJR141W 1044 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YAR030CYAR030C 342 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SPC29YPL124W 762 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YBR300CYBR300C 498 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 HPR1YDR138W 2259 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 MEF1YLR069C 2286 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 CET1YPL228W 1650 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 ACA1YER045C 1470 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 MSN4YKL062W 1893 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 CLG1YGL215W 1359 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 ITT1YML068W 1395 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 DSE1YER124C 1722 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 KEI1YDR367W 666 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 NKP1YDR383C 717 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 GUK1YDR454C 564 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YGR122WYGR122W 1209 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 CIC1YHR052W 1131 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 IRC19YLL033W 693 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SHP1YBL058W 1272 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 VAN1YML115C 1608 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 LEU1YGL009C 2340 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 PRI2YKL045W 1587 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 RGL1YPL066W 1440 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 ROG3YFR022W 2202 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 TRM8YDL201W 861 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SNO3YFL060C 669 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 RPL7AYGL076C 735 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YGR126WYGR126W 693 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SPL2YHR136C 447 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YLR126CYLR126C 756 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SNO2YNL334C 669 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YNR071CYNR071C 1029 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 PET123YOR158W 957 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 TAF14YPL129W 735 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 RPL7BYPL198W 735 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 MRPS5YBR251W 924 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 STP22YCL008C 1158 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 CST6YIL036W 1764 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 VBA1YMR088C 1689 nt5.31□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 ESF1YDR365C 1887 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 TNA1YGR260W 1605 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 PKC1YBL105C 3456 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 CEX1YOR112W 2286 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 ATE1YGL017W 1512 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 HMO1YDR174W 741 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 DJP1YIR004W 1299 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YLR296WYLR296W 327 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SSO2YMR183C 888 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 MOH1YBL049W 417 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YSF3YNL138W-A 258 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 HSH49YOR319W 642 nt5.3□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 RPT4YOR259C 1314 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 NAM9YNL137C 1461 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 ERP3YDL018C 678 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 DFM1YDR411C 1026 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SNX4YJL036W 1272 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SFT1YKL006C-A 294 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 CAP1YKL007W 807 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 NFU1YKL040C 771 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YKL131WYKL131W 522 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 CUZ1YNL155W 825 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YNL203CYNL203C 612 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 UBC11YOR339C 471 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YBR096WYBR096W 693 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 HSP78YDR258C 2436 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YMR111CYMR111C 1389 nt5.29□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 VPS70YJR126C 2436 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 KEX2YNL238W 2445 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 CDC37YDR168W 1521 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 RDS2YPL133C 1341 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 SIF2YBR103W 1608 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 RPS2YGL123W 765 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 MRF1YGL143C 1242 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 LYS5YGL154C 819 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 PET130YJL023C 1044 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YLR257WYLR257W 966 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 COS1YNL336W 1146 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 YOL029CYOL029C 606 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 UTP18YJL069C 1785 nt5.28□□□□□ -1.56
HDA2Q06629 UGA1YGR019W 1416 nt5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.4 ms