Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoa1Q00623 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms