Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFAMQ00059 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFAMQ00059 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFAMQ00059 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms