Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabpb2P81069 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabpb2P81069 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabpb2P81069 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms