Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBEYP58557 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBEYP58557 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBEYP58557 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBEYP58557 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBEYP58557 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YBEYP58557 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YBEYP58557 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBEYP58557 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBEYP58557 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBEYP58557 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBEYP58557 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBEYP58557 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YBEYP58557 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YBEYP58557 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YBEYP58557 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YBEYP58557 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBEYP58557 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBEYP58557 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBEYP58557 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBEYP58557 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBEYP58557 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBEYP58557 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms