Protein–RNA interactions for Protein: P56135

Atp5j2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5j2P56135 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5j2P56135 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5j2P56135 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms