Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpc4P51655 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc4P51655 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc4P51655 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms