Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNA2P51530 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNA2P51530 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNA2P51530 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DNA2P51530 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNA2P51530 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNA2P51530 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNA2P51530 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DNA2P51530 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNA2P51530 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNA2P51530 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNA2P51530 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNA2P51530 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNA2P51530 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNA2P51530 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNA2P51530 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNA2P51530 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNA2P51530 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNA2P51530 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNA2P51530 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNA2P51530 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNA2P51530 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNA2P51530 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNA2P51530 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNA2P51530 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNA2P51530 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNA2P51530 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNA2P51530 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNA2P51530 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNA2P51530 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNA2P51530 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNA2P51530 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNA2P51530 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNA2P51530 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNA2P51530 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNA2P51530 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNA2P51530 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNA2P51530 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNA2P51530 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNA2P51530 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNA2P51530 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNA2P51530 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNA2P51530 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms