Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELK3P41970 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELK3P41970 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELK3P41970 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELK3P41970 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK3P41970 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK3P41970 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK3P41970 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK3P41970 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK3P41970 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK3P41970 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK3P41970 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELK3P41970 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELK3P41970 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELK3P41970 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELK3P41970 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELK3P41970 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELK3P41970 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELK3P41970 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELK3P41970 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELK3P41970 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELK3P41970 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELK3P41970 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELK3P41970 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK3P41970 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK3P41970 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK3P41970 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK3P41970 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK3P41970 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK3P41970 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK3P41970 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELK3P41970 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK3P41970 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK3P41970 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELK3P41970 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms