Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM4SF1P30408 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM4SF1P30408 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TM4SF1P30408 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF1P30408 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF1P30408 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF1P30408 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF1P30408 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF1P30408 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF1P30408 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF1P30408 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TM4SF1P30408 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF1P30408 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms