Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTX3P26022 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTX3P26022 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTX3P26022 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTX3P26022 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTX3P26022 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTX3P26022 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTX3P26022 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms