Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLP19338 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLP19338 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLP19338 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLP19338 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLP19338 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLP19338 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLP19338 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLP19338 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCLP19338 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCLP19338 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NCLP19338 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NCLP19338 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NCLP19338 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCLP19338 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLP19338 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLP19338 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLP19338 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLP19338 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLP19338 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLP19338 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLP19338 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLP19338 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCLP19338 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCLP19338 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCLP19338 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCLP19338 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLP19338 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLP19338 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLP19338 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms