Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl9P18340 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl9P18340 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms