Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms