Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VDRP11473 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VDRP11473 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VDRP11473 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VDRP11473 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VDRP11473 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VDRP11473 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VDRP11473 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VDRP11473 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VDRP11473 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VDRP11473 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VDRP11473 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VDRP11473 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VDRP11473 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VDRP11473 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VDRP11473 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDRP11473 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms