Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GLI3P10071 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLI3P10071 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLI3P10071 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLI3P10071 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GLI3P10071 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GLI3P10071 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GLI3P10071 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GLI3P10071 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GLI3P10071 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GLI3P10071 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GLI3P10071 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GLI3P10071 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GLI3P10071 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
GLI3P10071 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
GLI3P10071 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GLI3P10071 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GLI3P10071 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GLI3P10071 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GLI3P10071 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI3P10071 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI3P10071 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI3P10071 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI3P10071 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI3P10071 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GLI3P10071 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI3P10071 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI3P10071 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI3P10071 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GLI3P10071 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GLI3P10071 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GLI3P10071 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI3P10071 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI3P10071 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI3P10071 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI3P10071 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI3P10071 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GLI3P10071 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI3P10071 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI3P10071 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI3P10071 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI3P10071 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI3P10071 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI3P10071 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GLI3P10071 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GLI3P10071 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GLI3P10071 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms