Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-AaP01910 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-AaP01910 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms