Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRDM1O75626 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM1O75626 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM1O75626 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms