Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr6O54689 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr6O54689 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms