Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLRMTO00411 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLRMTO00411 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLRMTO00411 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLRMTO00411 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLRMTO00411 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLRMTO00411 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLRMTO00411 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POLRMTO00411 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLRMTO00411 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLRMTO00411 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
POLRMTO00411 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms