Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21060J3KMU4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21060J3KMU4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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