Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRD1A4D1F6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms