Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Upf2A2AT37 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Upf2A2AT37 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms