Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tubb1A2AQ07 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb1A2AQ07 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms