Protein–RNA interactions for Protein: A2A4F1

Rhox7a, Reproductive homeobox 7A, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox7aA2A4F1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox7aA2A4F1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox7aA2A4F1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms