Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH3

AU041133, Expressed sequence AU041133, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU041133A0A0J9YVH3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU041133A0A0J9YVH3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AU041133A0A0J9YVH3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms