Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAE1Q9UBE0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms