Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N6

Syt8, Synaptotagmin-8, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt8Q9R0N6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt8Q9R0N6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt8Q9R0N6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms