Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Plod2Q9R0B9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod2Q9R0B9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod2Q9R0B9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms