Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF7

Hpgds, Hematopoietic prostaglandin D synthase, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdsQ9JHF7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpgdsQ9JHF7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HpgdsQ9JHF7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms