Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NRDE2Q9H7Z3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms