Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn12Q9ET43 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cldn12Q9ET43 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms