Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr61Q9ERF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr61Q9ERF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms