Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmd12Q9D8W5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmd12Q9D8W5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmd12Q9D8W5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms