Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nde1Q9CZA6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms