Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Chchd1Q9CQA6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chchd1Q9CQA6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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