Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ska1Q9CPV1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ska1Q9CPV1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms